1911年，文澜阁所藏《四库全书》由浙江图书馆接收保管，从此，阁与书分离。1929年，西湖博览会在杭州开幕，文澜阁作为农业馆使用。博览会结束后，成立“浙江省西湖博物馆”，选择文澜阁、王阳明祠、罗汉堂、太乙分青室等为馆址，并在头门建造门楼，正中嵌有“西湖博物馆”匾额。1953年，浙江省立西湖博物馆更名为浙江博物馆，文澜阁一直由其管理使用，并作为博物馆的一部分，对外开放。
经过多次修缮和不遗余力的保护，这座清代皇家藏书楼仍保留了原有建筑的格局及历史风貌。2006年，浙江省博物馆负责对文澜阁进行了1949年以来的第三次大修。依据《中华人民共和国文物保护法》，修缮保存了古代建筑原有的历史信息，还原了文澜阁的历史平面和院落空间。修缮后的文澜阁，通过专题陈列和原状性展示的形式，展现了文澜阁演变的历史过程，恢复了清代皇家藏书楼的历史风貌和江南古典园林的特色。
